используем пакет enca
# apt-get install enca
Для конвертации одного файла в кодировку локали дистрибутива (UTF-8 -
определяется автоматически):
$ enconv filename
Для конвертации нескольких файлов
$ find . -name "*.txt" -exec enconv {} \;
Источник: http://www.qdesnic.ru/cp1251toutf8.html