Чтобы в интерактивном режиме исследовать расход свободного места на диске, используйте программу ncdu. При запуске она считает расход места в текущей директории и всех вложенных (рекурсивно).
Чтобы посчитать объем директорий, вам необходим доступ на их чтение.
$ cd /
$ sudo ncdu